蛋白质组学理论和技术的发展与应用为阐明疾病的机制、发现新的诊断标志物及治疗新靶点提供了重要的手段。 由于蛋白质芯片，2D电泳结合质谱、噬菌体展示、图像分析、氨基酸测序等蛋白质定量和鉴定技术的发展，使我们能在几小时内同时研究数千种蛋白质在疾病状态下的变化。基因组的研究不能替代蛋白质组学的研究，因为基因组信息不能提供细胞功能的信息，而且任何细胞都不会同时表达所有的基因。另外由于细胞类型的不同以及所处环境和刺激因素的不同，细胞将会有选择的表达不同的基因，因此蛋白质组研究可以在任何给定的瞬间提供与细胞功能有关的全部蛋白质，这是蛋白质组学研究的主要目的。     结合微阵列和蛋白质组学研究技术，目前正在逐渐将扩张性心肌病（DCM）、肥厚性心肌病（HCM）、缺血性心脏病（IHD）、心衰以及缺血预适应等疾病的发病机制的研究进一步深入到基因表达、蛋白修饰、蛋白定位的水平。多种心脏病模型以及人类疾病和心衰的微阵列数据，以及来自于多个种属的正常和疾病心肌的2D电泳数据库现在互联网上可以获得，为心脏功能异常的研究提供了新的线索。     在慢性状况或疾病状态时，蛋白质组的变化常由于特定基因的上调或下调、同种异构体的转换或蛋白质的全新合成而发生改变。目前，在不同的心血管蛋白质组实验中已至少识别和鉴定了百余种蛋白质水平的变化。在心肌病发展的不同阶段，已经发现了一些新蛋白质的动态变化。这些蛋白质涉及能量的产生或应激反应，细胞的蛋白体或骨架等。它们在未来可能作为心血管病潜在危险因子的标志物或治疗的靶点。    我们应用以上蛋白质组学研究方法发现了数百个药物和疾